美國轉(zhuǎn)化基因組研究院（TGen）的研究人員通過全基因組測序，在轉(zhuǎn)移性三陰性乳腺癌（T**）中發(fā)現(xiàn)了之前未曾報道過的突變。這篇文章發(fā)表在近期的《Molecular Cancer Therapeutics》上。

　　三陰性乳腺癌是指雌激素受體（ER）、孕激素受體（PR）和人表皮生長因子受體（HER2）均呈陰性的一種特殊類型乳腺癌。在西方人群中，三陰性乳腺癌占全部乳腺癌的10%-15%，尤以非洲裔人群多見。來自亞洲的報告顯示，三陰性乳腺癌發(fā)病率為7%-19%，與白種人相差不多。這種疾病本身具有較高的侵襲性，術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移風(fēng)險高，且缺乏內(nèi)分泌治療，抗HER2靶向治療的機會。

　　領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是TGen的高級研究員、綜合癌癥基因組學(xué)部主任John Carpten。近年來，Carpten博士領(lǐng)導(dǎo)的研究小組利用新一代測序技術(shù)，對多個腫瘤開展了深入的基因組學(xué)圖譜分析，包括前列腺癌、鼻咽癌、三陰性乳腺癌和結(jié)腸癌等。在這項研究中，Life Technologies公司也給予了支持。

　　研究小組利用Life Tech的SOLiD 4平臺對來自不同族裔的轉(zhuǎn)移性T**患者的14個腫瘤樣本進行了分析，在十幾個基因中發(fā)現(xiàn)了明顯的突變及其他改變。這些腫瘤中突變最頻繁的基因是TP53腫瘤抑制基因，14個腫瘤中的7個有突變。而在兩名非洲裔美國人身上，也檢測到另一個腫瘤抑制基因CTNNA1的異常。ERBB4基因也有改變，此基因參與了懷孕和哺乳期間的乳腺腺體成熟，但之前從未與轉(zhuǎn)移性T**相關(guān)聯(lián)。

　　研究還包含了“異常值分析”，評估了每個腫瘤的表達模式，并與研究中的其他腫瘤進行比較。在研究的隊列入群中過表達的癌基因有：ALK, AR, ARAF, BRAF, FGFR2, GLI1, GLI2, HRAS, HSP90AA1, KRAS, MET, NOTCH2, NOTCH3和SHH。表達明顯降低的癌基因有：BRCA1, BRCA2, CDKN2A, CTNNA1, DKK1, FBXW7, NF1, PTEN和SFN。

　　每個腫瘤在基因組上都是獨特的，但在14個腫瘤中，有9個都包含了特定細胞通路的改變：RAS/RAF/MEK/ERK和PI3K/AKT/MTOR，有的是一條改變，有的是兩條都改變。

　　作者認為，轉(zhuǎn)移性T**的全基因組和轉(zhuǎn)錄組分析讓人們深入了解了這種癌癥的體細胞事件。這些基因組數(shù)具有望指導(dǎo)患者參與研究性的治療試驗，并為未來試驗提供假設(shè)。

　　Life Technologies公司的首席醫(yī)療官Paul Billings博士表示：“研究強調(diào)了基因組測序在改善癌癥治療上的潛在臨床價值。我們希望在不遠的將來，更多患者和醫(yī)生能夠用到測序?；蚪M測序最終將成為腫瘤科醫(yī)生的標準工具，讓他們能夠為每位患者度身定制療法。”