2012年11月1日，由中、美、英等多個國家共同發(fā)起的大型國際合作項(xiàng)目“千人基因組計劃”的最新研究成果 在《自然》（Nature）上在線發(fā)表。該協(xié)作組公布了高分辨率的人類基因組遺傳變異整合圖譜，將為基因組學(xué)在人類疾病與健康領(lǐng)域中的應(yīng)用以及個體化醫(yī)療時代的到來奠定了堅(jiān)實(shí)的科學(xué)基礎(chǔ)。華大基因作為該計劃的發(fā)起者之一，承擔(dān)了近四分之一的工作。

    “千人基因組計劃”是2008年初，由中國深圳華大基因研究院、英國桑格研究所以及美國**人類基因組研究所等多家機(jī)構(gòu)共同啟動的一項(xiàng)大規(guī)模測序計劃。在這一計劃中，科學(xué)家將對全球各地至少2,500個人類個體的基因組進(jìn)行測序，繪制最詳盡的人類基因多態(tài)性圖譜，尋找基因與人類疾病之間的關(guān)系。結(jié)合這些測序信息，將形成一個更加精細(xì)的公開的人類基因組變異數(shù)據(jù)庫，從而為人類疾病研究提供科研基礎(chǔ)。

    該國際協(xié)作組已于2010年完成了“千人基因組計劃”第一階段的任務(wù)，對于人群攜帶5%以上的基因變異，繪制出了覆蓋度95%的基因多態(tài)性圖譜。但是對于基因編碼區(qū)以外富集潛在功能變異的低頻突變，則很少進(jìn)行闡釋。因此第一階段完成后的目標(biāo)則是集中于對更大規(guī)模的人群中低頻突變的研究，尤其是低頻點(diǎn)突變和結(jié)構(gòu)變異，以便鑒定出更多的功能變異標(biāo)志。

    在“千人基因組計劃”此次最新的研究報告中，協(xié)作組對來自歐洲、東亞、非洲和美洲14個種族的1,092個個體進(jìn)行了研究，并結(jié)合全基因組測序、外顯子目標(biāo)序列捕獲和SNP分型等技術(shù)構(gòu)建了變異圖譜。通過開發(fā)新的方法對多種不同算法和不同來源的數(shù)據(jù)進(jìn)行整合，最終協(xié)作組成功的繪制出了高分辨率和高精度的單體型圖譜，其中包括3,800萬個單核苷酸變異位點(diǎn)，140萬個插入/缺失位點(diǎn)以及超過1.4萬個大片段缺失。這些數(shù)據(jù)資源涵蓋了不同種族人群基因組中攜帶1%以上的突變，其中覆蓋度達(dá)98%以上。

    自“千人基因組計劃”第一階段研究成果公布以來，千人基因組數(shù)據(jù)庫已經(jīng)廣泛應(yīng)用于各種遺傳性疾病和癌癥基因組等研究，而這次更加詳盡和精確的研究結(jié)果，以及在不同種族個體中發(fā)現(xiàn)的與功能相關(guān)的罕見、低頻以及常見變異信息，將會進(jìn)一步促進(jìn)該數(shù)據(jù)庫的利用，為其他人類醫(yī)學(xué)疾病研究提供基礎(chǔ)。

    在千人基因組數(shù)據(jù)庫的使用中，其提供的全基因組范圍內(nèi)的變異結(jié)合其他大型項(xiàng)目（如ENCODE）中所獲得的正常功能信息，可能會促進(jìn)與疾病相關(guān)的非編碼變異檢測的效力。此外，越來越多的證據(jù)表明被全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）中所忽視的低頻突變對復(fù)雜疾病有相當(dāng)重要的影響，而該數(shù)據(jù)庫中所提供的低頻突變信息則為未分類位點(diǎn)的基因型填補(bǔ)提供基礎(chǔ)，

    華大基因在本次研究成果中，主要承擔(dān)了全部中國人（包括北京漢族人和南方漢族人）的樣本收集、8個種族272個個體的全基因組測序、11個種族375個個體的外顯子測序以及數(shù)據(jù)分析中關(guān)于插入/缺失和結(jié)構(gòu)變異的檢測和分析。此外，華大基因還參與了數(shù)據(jù)質(zhì)控和協(xié)調(diào)等工作。

    華大基應(yīng)該項(xiàng)目負(fù)責(zé)人郭小森表示：“這項(xiàng)工作完成了一個更高分辨率的人類基因變異圖譜，尤其是其中涵蓋了低頻突變位點(diǎn)。這將有助于全球科研人員更深入地去探索人類遺傳性疾病中表型和基因型之間的聯(lián)系。因此，這不僅是對整個千人基因組計劃，而且對人類遺傳疾病的研究，都是一個里程碑式的成果。”

    華大基因執(zhí)行院長王俊表示：“千人基因組計劃為從發(fā)現(xiàn)基因到解析基因奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)，是全球科學(xué)家在人類健康領(lǐng)域向個體化醫(yī)療邁進(jìn)的重要一步。我們將向全球科學(xué)家公開該研究中的全部數(shù)據(jù)，以充分發(fā)揮這些研究結(jié)果的價值，從中挖掘更多的信息，更好的探索人類生老病死的奧秘。”