基因組生物學(xué)技術(shù)進展大會(Advances in Genome Biology and Technology, AGBT)舉辦地:美國佛羅里達州馬可島(MarcoIsland)被奉為基因測序領(lǐng)域的圣地,每年都有大批研究基因測序的公司及科研人員會聚于此,分享最新科技成果。
兩年前,英國牛津納米孔技術(shù)公司(OxfordNanopore)曾宣布,該公司已成功研發(fā)出對特定DNA片段進行測序的新技術(shù),但很多人認為該方法并不現(xiàn)實。與其他技術(shù)相比,這一技術(shù)可以閱讀更長的DNA片段(因此有望用于對細菌DNA的混合樣本進行測序),并能實時顯示結(jié)果。這種測序采用電泳技術(shù),借助電池驅(qū)動單個分子逐一通過納米孔實現(xiàn)測序。由于納米孔的直徑非常小,僅僅允許單個核酸聚合物通過,因此,可以在此基礎(chǔ)上使用多種方法進行高通量測序。而且,納米級別的孔徑保證了檢測具有良好的持續(xù)性,因此測序的準確度非常高。
經(jīng)過兩年的沉寂,日前該公司又投下了一顆“重磅**”。盡管該公司并未派人到佛羅里達參會,但和該公司合作的一名研究人員在會上報告,他已經(jīng)利用新技術(shù)成功對病毒進行測序,并利用收集到的數(shù)據(jù)將微生物基因組信息拼湊在一起?,F(xiàn)在,該公司已經(jīng)在兌現(xiàn)先前的承諾,并呼吁科學(xué)家加入到檢驗新技術(shù)的項目中。然而,并不是每個人都看好該公司的這一“壯舉”,很多人認為在沒有外界幫助的情況下,其獲得的DNA測序數(shù)據(jù)很難分析出完整的基因組信息。
與此同時,很多傳統(tǒng)基因測序公司也在你追我趕,致力于降低測序成本。Illumina公司是目前最大的測序儀器制造商,1月,該公司承諾讓“1000美元基因組”成為現(xiàn)實,讓基因測序成為醫(yī)療服務(wù)的常規(guī)項目。
Illumina公司宣布的新一代測序儀能準確測出全基因組序列,其成本不到1000美元。新測序儀擁有很快的全基因組測序速度,旨在理解人類疾病和自然的遺傳突變。盡管這一設(shè)想在20年前就已提出,但在2012年才成為現(xiàn)實——當(dāng)時英國牛津納米孔技術(shù)公司推出了第一款商用納米孔測序儀。
加州大學(xué)圣克魯茲分校納米孔測序技術(shù)專家DavidDeamer說:“我已經(jīng)等不及了。人們希望趕緊嘗試這種新技術(shù)。有些人希望對食物中的微生物進行實時分析以測試食品安全,夢想家希望看看該技術(shù)能否處理有16000個堿基對的DNA片段。我們已準備好向該技術(shù)發(fā)起挑戰(zhàn)。”
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