中美科研人員利用高通量序列測定來測序和定量RNA進行轉(zhuǎn)錄組分析的方法,對來自幼年、青春期、成年及老年的雌雄且具有正常免疫功能的Fischer344大鼠、涵蓋11種器官和4個發(fā)育階段的大鼠320個樣本進行了RNA測序,由此構(gòu)建出了一張綜合大鼠轉(zhuǎn)錄組圖譜,繪制出40064個基因和65167種轉(zhuǎn)錄物表達譜。
由復旦大學藥學院石樂明教授和美國洛馬林達大學CharlesWang博士作為共同通訊作者的反應該研究成果的論文,于2月10日發(fā)表在《自然·通訊》雜志上。專家認為,該大鼠轉(zhuǎn)錄組圖譜可與其他數(shù)據(jù)庫交聯(lián),通過網(wǎng)絡獲取,為利用大鼠模型開展生物醫(yī)學研究提供了一個重要的資源。
大鼠可用來開展藥物和化學毒性測試,評估潛在藥物效應機制,以及模擬人類疾病。利用RNA測序編寫出從出生到老年整個大鼠生命期以及兩性之間的轉(zhuǎn)錄組差異變化表,能夠提供關(guān)于疾病易感性、藥物療效與安全性、毒性機制的一些新認識,最終促使一些臨床前研究成果轉(zhuǎn)化應用于人類疾病防止。
科研人員還發(fā)現(xiàn)了一些器官富集、差異性表達的基因,反映出已知的器官特異性生物活性。大量的轉(zhuǎn)錄物還顯示出器官特異性、年齡依賴性或性別特異性的差異表達模式。
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